日前，山東省政府做出對菏澤港總體規劃(2015-2030年) 的同意批復，菏澤港將形成以巨野港區為核心港區，成武港區、鄆城港區、定陶港區為重要港區的“一港四區”總體格局，逐步發展成為具備裝卸倉儲、中轉換裝、運輸組織、臨港開發、現代物流、生產生活等基本功能的綜合性、現代化內河港口。

菏澤港是山東省內河地區性重要港口，港口發展以大宗散貨運輸為主，積極發展件雜貨和集裝箱運輸，菏澤港規劃港口岸線21154米，其中已利用岸線1942米、規劃期利用岸線11876米、預留岸線7336米。

規劃期內菏澤港將形成以巨野港區為核心港區，成武港區、鄆城港區、定陶港區為重要港區的“一港四區”總體格局，4個港區下設10個作業區(另預留1個作業區)。近期以巨野港區為核心港區，結合航道開發逐步建成成武、鄆城、定陶等港區。

其中，巨野港區以大宗干散貨、件雜貨運輸為主，積極發展集裝箱運輸業務，主要為巨野縣煤炭出運、臨港產業園區及城市生產生活服務;鄆城港區以大宗干散貨、件雜貨運輸為主，積極發展集裝箱運輸業務，主要為鄆城縣煤炭出運、城市生產生活和臨港物流產業服務;成武港區以大宗干散貨、件雜貨運輸為主，積極發展集裝箱運輸業務，主要為曹縣、單縣煤炭出運、臨港工業及城市生產生活服務;定陶港區，以大宗干散貨、件雜貨運輸為主，積極發展集裝箱運輸業務，發展鐵水聯運功能，主要為菏澤市及東明縣化工園區及城市生產生活服務。